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我國科學家獲得首個染色體級別橡膠樹參考基因組圖譜

2019-12-19 09:25:51    焦宏

由云南省熱帶作物科學研究所特聘研究員、中國科學院昆明植物研究所研究員、熱帶作物種質資源與基因組學云南省創新團隊首席科學家高立志教授帶領的云南省熱帶作物科學研究所、中國科學院昆明植物研究所和華南農業大學基因組學與生物信息學研究中心的聯合研究團隊,歷經6年,在國際上首次獲得了達到染色體級別的高質量巴西橡膠樹優良品種GT1的參考基因組序列,并揭示大戟植物基因組的染色體進化、膠乳生物合成與橡膠樹的馴化。該研究為橡膠樹的高產、抗病、抗旱、抗寒等重要經濟性狀的基因組選擇育種與優異基因資源的發掘利用提供了染色體級別的高質量橡膠樹參考基因組圖譜。

論文第一作者、云南省熱帶作物科學研究所柳覲研究員介紹,與以前發表的基因組草圖比較基因組學分析表明,該研究獲得的基因組圖譜在組裝準確性與完整性上都得到了極大的提升;將組裝獲得的約1.47Gb的基因組序列掛載到了18條假染色體上;研究進一步證實,在木薯屬與橡膠屬分化之前二者共同的祖先里發生過古多倍化事件;通過染色體水平上的比較基因組學分析首次構建了大戟植物的染色體演化模型。

據介紹,巴西橡膠樹這一重要參考基因組的獲得、膠乳生物合成代謝通路的解析、栽培和野生橡膠樹基因組變異精準圖譜的構建以及栽培橡膠樹馴化的認識,對我國未來橡膠優異種質資源的保護、發掘與育種利用具有重要的戰略意義。

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